由于新生儿身体各器官发育不成熟，新生儿在用药过程中要比成人更加谨慎，这样才能既帮助孩子早日康复，又能在最大程度上避免药物的毒副作用对孩子造成的不良影响。
用药特点
　　1.药物吸收多 口服用药时，婴幼儿的胃酸偏少，胃酶活性较低，胃排空迟缓，肠蠕动不规则，特殊转运能力弱，某些易受胃酸、胃酶和肠道酸碱度影响的口服药物，婴幼儿的吸收量较成人多。皮肤用药时，由于儿童的皮肤娇嫩，血管丰富，药物容易透皮吸收，皮肤破损时吸收量就更多了。如有用硼酸溶液湿敷治疗尿布皮炎，发生病儿中毒死亡的报道。故皮肤用药，婴幼儿的吸收量也较成人多。
　　2.血药浓度高 一方面，新生儿细胞外液较多，这样就影响了某些按脂—水分配系数在体内分布的药物（如磺胺、青霉素、头孢菌素、速尿等），可使血中药物浓度增高。 另一方面，由于婴幼儿体内血清蛋白量不仅比成　　人少，而且与药物的结合力也较弱，因而造成血中游离药物浓度增高。易出现多种不良反应。
　　3.代谢排泄能力弱 药物的代谢和排泄有赖于肝脏和肾脏功能是否健全。婴幼儿肝、肾发育尚不完善，所以对药物的清除和排泄较慢。如新生儿用磺胺类药物可使血胆红质浓度增高加之代谢能力较低易出现核黄疸症。 又如新生儿肝脏功能不健全，服用氯霉素后可引起「灰婴综合征」。故小儿不准服用氯霉素和磺胺药物。
用药禁区
　　1.解热镇痛药物
　　新生儿使用阿司匹林或含阿司匹林的制剂，易导致雷耶氏 (Reyes) 综合征（一种常见的急性脑部疾病，病死率高达 50%）。阿司匹林对婴幼儿的听神经也有损害。
　　2.止泻药物
复方地芬诺酯，适用于急、慢性功能性腹泻和慢性肠炎的治疗。该药每片含盐酸地芬诺 2.5 mg、硫酸阿托品 0.025 mg，其中地芬诺酯对肠道作用类似吗啡，可直接作用于肠平滑肌。由于国内外不断有应用该药致小儿中毒甚至致死的报道（死亡病例集中于小于 2 岁的婴幼儿），又因该药小儿用药剂量至今尚无统一标准，因此 2 岁以下婴幼儿禁用，2 岁以上小儿应慎重使用（严格控制用药剂量）。
　　3.抗过敏药物
　　盐酸苯海拉明、茶苯海明、盐酸地芬尼多等，6 个月以下婴幼儿禁用。
　　4.四环素类药物
　　四环素类药物可引起牙釉质发育不良、牙齿着色变黄和骨生长抑制，所以 8 岁以下儿童禁用。
　　5.喹诺酮类药物
　　这类药物可引起幼年狗及其他哺乳动物的骨关节，特别是负重骨关节软骨组织的损伤，故 18 岁以下未成年人禁用。
　　6.其它抗感染药物
　　磺胺类、呋喃妥因、呋喃唑酮、氯霉素、新生霉素可使新生儿出现溶血、灰婴综合征、高胆红素血症，故新生儿禁用。
　　7.激素类药物
　　雄激素如甲睾酮、丙酸睾酮等长期应用会使骨骼闭合过早，影响小儿生长发育，尤其是正在患水痘的小儿更要禁用。
　　8.氨基糖苷类药物
　　如链霉素、庆大霉素、小诺霉素、阿米卡星、西索米星等，连续使用易造成幼儿听神经和肾功能损害，6 岁以下儿童禁用。